肝腺瘤的病因尚未完全明確，發病可能與性內分泌紊亂有關，嬰兒病例可能與先天性胚胎發育異常有關，Henson認為后天性因素可能與肝硬化和肝細胞結節增生密切相關。現在認為它的發生與口服避孕藥密切相關:這種病在20世紀50年代~60年代很少見，口服避孕藥并不常見；超過900A，肝腺瘤患者發生于年輕女性，至少75%的患者有服藥史，30歲以上服用該藥物的婦女患病風險增加；肝腺瘤的發病率與服用該藥物的時間和劑量直接相關；停止服用避孕藥后，患者可見腫瘤萎縮；妊娠期腫瘤增加；絕經后肝腺瘤很少發生在婦女身上。肝腺瘤的病因可能與糖尿病、糖原儲積癥和雄激素的使用有關。
肝腺瘤病理上分為肝細胞腺瘤、膽管腺瘤(包括膽管腺瘤和膽管囊腺瘤)和混合腺瘤。70%以上的肝腺瘤為單發，多位于肝右葉(67%)，顏色與周圍肝相似，邊界清晰；腫瘤直徑多為1~20cm，大者可超過30cm，2/3病變直徑>5cm;腫瘤常有包膜，無包膜者易癌變。鏡下肝腺瘤細胞呈索狀排列，扭結失去正常肝小葉結構，無匯管區結構。腺瘤細胞比正常細胞大而蒼白，細胞內有糖原和脂肪沉積，無細胞核分裂和細胞異型，核漿比例正常。
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