肛門閉鎖可通過手術重建、腸道造口、術后護理等方式治療。肛門閉鎖是一種先天性消化道畸形，主要表現為新生兒無正常肛門開口，常合并直腸尿道瘺或直腸陰道瘺等異常結構。
手術重建是治療肛門閉鎖的主要方法。低位肛門閉鎖通常采用會陰肛門成形術，在肛門正常位置切開皮膚和肌肉，將直腸末端拖出與皮膚吻合。高位肛門閉鎖需經腹會陰聯合手術，必要時需先行結腸造口術分流糞便。
腸道造口常用于高位畸形或合并嚴重并發癥的患兒。臨時性結腸造口可減少感染風險，待患兒生長至合適體重后再行根治手術。永久性造口適用于合并脊柱畸形或嚴重心臟病的復雜病例。
術后護理對恢復肛門功能至關重要。需定期擴張新建肛門防止狹窄，訓練排便反射。合并瘺管的患兒術后可能出現尿失禁或反復尿路感染，需長期隨訪。多數患兒經規范治療可獲得正常排便功能，但部分高位畸形可能遺留排便控制障礙。
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