金梔潔齦含漱液應避免與抗菌藥物、含碘制劑、堿性藥物、重金屬鹽類藥物及局部麻醉劑合用，可能降低藥效或產生不良反應。
1、抗菌藥物：
金梔潔齦含漱液中的黃芩苷等成分具有抗菌作用，與頭孢克肟、阿莫西林、左氧氟沙星等抗菌藥物聯用可能導致藥效重疊或拮抗。口腔局部使用抗菌藥物時，建議間隔2小時以上。
2、含碘制劑：
含漱液中的鞣質成分與西地碘含片、聚維酮碘溶液等含碘藥物接觸后，可能生成沉淀物影響口腔黏膜吸收。碘制劑使用后需用清水漱口，30分鐘后再使用該含漱液。
3、堿性藥物：
碳酸氫鈉漱口液等堿性藥物會改變口腔pH值，導致含漱液中梔子苷等酸性成分分解失效。兩者需間隔1小時使用，優先選擇生理鹽水作為過渡清潔。
4、重金屬鹽類：
含漱液中的多酚類物質與硝酸銀溶液、蛋白銀等重金屬制劑結合會產生不溶性復合物，不僅降低療效還可能刺激口腔黏膜。牙科治療后使用重金屬類藥物者，當日應暫停含漱液。
5、局部麻醉劑：
利多卡因膠漿、丁卡因噴霧等局部麻醉劑會暫時抑制口腔感覺，與含漱液合用可能掩蓋過敏反應。建議麻醉效果消退后再使用含漱液，出現灼熱感應立即停用。
使用金梔潔齦含漱液期間應避免飲酒及辛辣食物，每日含漱不超過3次。含漱后30分鐘內勿進食飲水，配合巴氏刷牙法及牙線清潔可增強效果。糖尿病患者需監測血糖變化，孕婦使用前應咨詢醫師。出現黏膜脫皮或味覺異常需及時停藥就醫。
