接種新冠疫苗可能有副作用，但一般副作用較小。如有接種禁忌癥，接種新冠疫苗的副作用較大。
目前接種的新冠疫苗大多為滅活疫苗和減毒疫苗，與其他疫苗一樣不能100%的保證不會出現副作用。但新冠疫苗臨床試驗數據顯示，接種后引起的不良反應一般較輕，如接種部位有紅腫、疼痛、瘙癢等表現，還可能出現頭暈、嗜睡、低燒、惡心、嘔吐、渾身無力、肌肉酸痛等全身不適癥狀。只要在接種疫苗后能注意多休息，避免過度勞累，清淡飲食，避免吃辛辣、腥發食物等，多喝水加速新陳代謝，不適癥狀通常會在接種疫苗1-3天內自行消退，不會對身體健康造成太大的影響。
但接種新冠疫苗有禁忌癥，不可盲目接種。如對新冠疫苗中的某種成分過敏，或接種其他疫苗時曾經有嚴重的過敏反應，應禁止接種新冠疫苗，否則可能會出現嚴重的過敏反應，導致心慌、窒息、休克等。正在發燒，疾病處在急性發作期、癲癇未有效控制、患嚴重神經系統疾病等，一般不建議接種疫苗，否則可能使著身體不適加重，還會影響疫苗的接種效果。
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