龜頭炎的檢查項目主要包括體格檢查、實驗室檢查和影像學檢查三類。具體檢查方式需根據臨床表現和疑似病因選擇，常見項目有分泌物涂片、尿常規、真菌培養等。
體格檢查是診斷龜頭炎的基礎步驟。醫生會觀察陰莖頭部及包皮的紅腫、糜爛、分泌物等病變特征，觸診檢查有無淋巴結腫大。急性感染期可見明顯充血水腫，慢性炎癥可能伴隨皮膚增厚或色素沉著。
實驗室檢查中，分泌物涂片檢查可快速鑒別細菌性、真菌性或滴蟲性感染。革蘭染色能識別鏈球菌、葡萄球菌等致病菌，10%氫氧化鉀溶液處理有助于發現念珠菌菌絲。尿常規檢查可排除尿路感染合并癥，白細胞酯酶陽性提示可能存在泌尿系統炎癥。
病原學培養是明確致病微生物的金標準。細菌培養需采集病灶分泌物接種于血平板，真菌培養使用沙氏培養基，必要時進行藥敏試驗指導用藥。血清學檢查適用于疑似梅毒或皰疹病毒感染，需檢測特異性抗體如梅毒螺旋體顆粒凝集試驗。
少數情況下需借助影像學檢查。超聲檢查適用于合并尿道狹窄或膿腫形成的患者，能評估病變范圍和周圍組織受累情況。陰莖海綿體造影僅用于懷疑特異性感染導致海綿體纖維化的病例。
對于反復發作或治療無效的龜頭炎，建議進行組織病理學檢查。活檢可鑒別漿細胞性龜頭炎、扁平苔蘚等特殊類型，排除癌前病變。免疫組化檢查有助于診斷自身免疫相關性疾病。
