鼻通寧滴劑不能與減充血劑、抗組胺藥、單胺氧化酶抑制劑、三環類抗抑郁藥、β受體阻滯劑等藥物同時使用。鼻通寧滴劑主要成分為鹽酸麻黃堿，可能與其他藥物發生相互作用，導致血壓升高、心率加快等不良反應。
鼻通寧滴劑與減充血劑合用可能加重鼻腔黏膜干燥，增加鼻出血風險。減充血劑如偽麻黃堿、羥甲唑啉等與鼻通寧滴劑作用機制相似，重復使用會導致藥物過量。鼻腔局部長期使用減充血劑可能引起反彈性鼻充血，與鼻通寧滴劑聯用會加劇癥狀。
鼻通寧滴劑與抗組胺藥聯用可能掩蓋過敏癥狀，延誤病情判斷。抗組胺藥如氯雷他定、西替利嗪等通過抑制組胺受體緩解過敏，而鼻通寧滴劑通過收縮血管減輕鼻塞，兩者合用可能相互干擾療效。部分抗組胺藥具有鎮靜作用，與鼻通寧滴劑的中樞興奮作用可能產生拮抗。
使用鼻通寧滴劑期間應避免攝入含咖啡因的飲品，防止加重心血管負擔。高血壓、冠心病、甲狀腺功能亢進患者慎用該藥物，用藥期間需監測血壓和心率變化。鼻腔局部用藥不宜超過7天，如癥狀未緩解應及時就醫調整治療方案。孕婦、哺乳期婦女及6歲以下兒童應在醫生指導下使用。
