抗瘧藥物除了治療外，還具有預防作用。抗瘧藥物的應用必須了解瘧原蟲的發育和生長過程，因為其過程與藥物的作用密切相關。只有這樣，我們才能合理使用，獲得最佳療效。
瘧原蟲進入人體后，分為前期紅細胞、外期紅細胞、內期紅細胞和配子體。各種抗瘧藥物通過影響其不同的發育階段來發揮作用。
1.在紅細胞的早期階段，在進入紅細胞之前，立即應用有效的乙胺嘧啶，即有預防作用。
2．紅細胞外期除進入紅細胞外，一部分還侵入其他肝細胞，繼續增殖分裂，稱為紅細胞外期，一旦機體抵抗力下降，即進入紅細胞內導致復發。伯氨喹等有效藥物可防止復發。 3.紅細胞在內期變成裂殖體，在紅細胞中進行。大量裂殖體破壞紅細胞會導致瘧疾的臨床癥狀。氯喹等藥物能控制癥狀，殺滅裂殖體。
4.當蚊子叮咬患者吸血時，配子體和雄配子體進入蚊子進行性生殖，成為瘧疾傳播和流行的根源。伯氨喹對配子體有很強的殺滅作用，可以防止傳播。
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