益生菌粉的服用時間可根據空腹狀態、餐后時機、用藥間隔、運動前后及睡眠周期調整，建議搭配溫水或低溫飲品沖服。
1、空腹服用：
晨起空腹時胃酸分泌較少，益生菌存活率較高。此時服用可減少胃酸對菌群的破壞，利于活菌直達腸道定植。避免與咖啡、濃茶同服，水溫需控制在40℃以下。
2、餐后補充：
餐后30-60分鐘胃酸濃度降低，食物殘渣形成保護層。選擇含膳食纖維的餐食后服用，如燕麥、紅薯等，可延長益生菌在消化道的停留時間，提升結腸存活率。
3、藥物錯峰：
抗生素使用期間需間隔2小時以上服用，避免藥物滅活益生菌。與抑酸劑同服時，建議優先選擇布拉氏酵母菌等耐酸菌株，減少胃酸環境的影響。
4、運動前后：
高強度運動后1小時補充，可緩解腸道氧化應激。搭配BCAA支鏈氨基酸或低聚果糖，增強菌群對腸黏膜的修復作用，但避免與運動飲料同時攝入。
5、睡前服用：
夜間腸道蠕動減緩，菌群有更長時間黏附腸壁。選擇含雙歧桿菌的制劑，配合少量無糖酸奶食用，能協同促進短鏈脂肪酸的夜間合成。
日常可搭配發酵食品如泡菜、味噌強化效果，避免與超過50℃的熱飲同服。持續補充4-12周能達到較佳菌群平衡，急性腹瀉期間需增加至每日2-3次。特殊菌株如羅伊氏乳桿菌建議餐前服用，植物乳桿菌更適合餐后補充。服用期間觀察排便性狀變化，出現腹脹可減半劑量適應。
