柴黃顆粒不能與含有對乙酰氨基酚、阿司匹林、抗凝血藥、免疫抑制劑以及部分抗生素的藥物合用。柴黃顆粒主要成分柴胡、黃芩等具有解熱、抗炎作用，與上述藥物聯用可能增加不良反應風險或影響藥效。
1、對乙酰氨基酚
柴黃顆粒與對乙酰氨基酚合用可能加重肝臟負擔。兩者均通過肝臟代謝，聯用會增加肝損傷風險，可能出現轉氨酶升高或藥物性肝炎。肝功能異常患者尤其需避免合用，用藥期間應監測肝功能指標。
2、阿司匹林
柴黃顆粒與阿司匹林聯用可能增加消化道出血概率。黃芩中的黃酮類成分與阿司匹林協同作用會抑制血小板聚集，延長凝血時間。胃腸潰瘍患者或老年人需特別注意，必要時需間隔4小時以上服用。
3、抗凝血藥
華法林等抗凝血藥與柴黃顆粒合用可能增強抗凝效果。柴胡中的皂苷成分會影響維生素K代謝，導致凝血酶原時間延長。正在服用抗凝藥物的患者需密切監測INR值，調整藥物劑量。
4、免疫抑制劑
環孢素等免疫抑制劑與柴黃顆粒聯用可能降低藥效。柴黃顆粒可通過調節免疫功能影響免疫抑制劑的代謝過程，導致血藥濃度不穩定。器官移植術后患者應避免同時使用。
5、部分抗生素
四環素類抗生素與柴黃顆粒合用可能形成絡合物。黃芩中的金屬離子成分會與抗生素結合，減少腸道吸收率。建議兩者間隔2小時以上服用，或改用其他類別抗生素。
服用柴黃顆粒期間需注意飲食清淡，避免辛辣刺激性食物。用藥前應詳細告知醫生正在使用的所有藥物，包括處方藥、非處方藥及中藥制劑。出現皮疹、惡心等不適癥狀應立即停藥就醫。慢性病患者用藥需在醫師指導下調整方案，不可自行聯合用藥。建議用藥期間定期復查血常規、肝腎功能等指標，觀察藥物相互作用可能產生的影響。
