長期吃拜糖平有副作用。拜糖平是2型糖尿病患者的第一線降糖藥物，其副作用主要體現在胃腸道不適、肝功能異常以及其他副作用等。
1、胃腸道不適
拜糖平的副作用多見于胃腸道的癥狀，出現胃腸脹氣、腹瀉、腹痛、排氣增多、惡心，嘔吐等。每個人服用拜糖平胃腸道的反應有輕有重，大多數患者癥狀較輕微，藥物可耐受。若少數患者出現上述的胃腸道癥狀比較嚴重，則應停止服用該類的降糖藥物，并在醫生指導下更換合適的藥物。此外，有消化吸收障礙的慢性胃腸功能紊亂患者，不適合服用本品。
2、肝功能異常
有個別患者，長期較大劑量服用拜糖平后會出現無癥狀的肝酶升高的情況，因此一般在服藥的前12個月，建議定期檢查肝功能，一般停藥后肝酶可恢復正常。
3、其他副作用
極個別病例可能出現諸如紅斑、皮疹和蕁麻疹等皮膚過敏反應，以及觀察到水腫的發生。也有極個別病例發生輕度腸梗阻或腸梗阻，但是概率較低。
患者服用拜糖平前應注意糖尿病昏迷及昏迷前期，酸中毒或酮癥患者禁用；有明顯消化和吸收障礙的慢性胃腸功能紊亂患者禁用；患有由于腸脹氣而可能惡化的疾患，如嚴重的疝、腸梗阻、腸道術后和腸潰瘍的病人禁用；肝、腎功能損害的患者禁用。此外。服用拜糖平期間，還應注意避免服用一些影響其在腸道發揮作用的藥物，如考來烯胺、蒙脫石散、其他的腸道吸附劑和消化酶類制劑等，以免影響療效。
