止咳橘紅膠囊不能與中樞性鎮咳藥、含麻黃堿類藥物、抗膽堿藥物、單胺氧化酶抑制劑、強心苷類藥物等合用。止咳橘紅膠囊含有多種中藥成分，與上述藥物聯用可能產生藥理拮抗或增加不良反應風險，需在醫生指導下調整用藥方案。
止咳橘紅膠囊作為中成藥，主要成分包括化橘紅、陳皮、半夏等，具有化痰止咳功效。與中樞性鎮咳藥如右美沙芬合用會抑制咳嗽反射，導致痰液滯留加重呼吸道感染；與含麻黃堿的感冒藥聯用可能過度刺激交感神經，引發心悸或血壓升高；抗膽堿藥物如阿托品可能增強其燥濕化痰作用，導致口干、便秘等不良反應加劇。
單胺氧化酶抑制劑如異煙肼與止咳橘紅膠囊聯用可能引發頭痛、高熱等酪胺反應；強心苷類藥物如地高辛與其中鉀離子結合成分相互作用，可能影響電解質平衡而增加心律失常風險。特殊人群如肝腎功能不全者代謝能力下降，更易發生藥物蓄積毒性。服藥期間應避免飲酒或食用辛辣食物，防止刺激胃腸黏膜影響藥效吸收。
使用止咳橘紅膠囊期間需主動告知醫生正在服用的所有藥物，包括處方藥、中成藥及保健品。出現心慌、頭暈等不適時應立即停藥就醫，服藥期間保持飲食清淡，適量增加飲水量幫助稀釋痰液。慢性咳嗽超過兩周或伴有發熱、胸痛等癥狀，需及時進行胸部影像學檢查排除肺部器質性疾病。
