灰指甲的鑒別診斷需與足癬、銀屑病甲、扁平苔蘚甲損害、甲營養不良及外傷性甲改變等疾病區分。
1、足癬：
足癬常伴隨趾間糜爛或水皰，真菌鏡檢陽性率較高。甲板病變多從游離緣開始，呈黃白色渾濁，但較少出現甲板增厚或分層。需結合皮膚病變特征與灰指甲區分，必要時進行真菌培養明確菌種。
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2、銀屑病甲：
甲板出現頂針樣凹陷或油滴樣改變，甲下角質堆積呈黃褐色。患者通常伴有頭皮、肘膝部位的銀屑病皮損，無真菌感染證據。甲周可見特征性紅斑鱗屑，病變多累及多個指甲且對稱分布。
3、扁平苔蘚：
甲板變薄出現縱嵴或裂隙，嚴重時甲母質破壞導致永久性甲缺失。甲周皮膚可見紫紅色扁平丘疹，口腔黏膜常同時受累。組織病理檢查可見典型苔蘚樣淋巴細胞浸潤帶。
4、甲營養不良：
甲板變薄易碎，表面出現橫溝或縱嵴，多由慢性疾病或營養缺乏導致。常見于缺鐵性貧血患者，甲床蒼白且反甲現象明顯。無真菌感染證據，改善基礎疾病后甲病變可逆轉。
5、外傷性甲改變：
甲板出現白斑、裂片狀出血或甲分離，有明確外傷史。病變局限于受傷指甲，周圍甲板結構正常。長期機械刺激可導致甲板增厚變形，需結合職業史與灰指甲鑒別。
日常需保持足部干燥透氣，避免共用修甲工具。建議選擇吸濕排汗的棉質襪子，每日用白醋泡腳輔助抑菌。運動時穿著專業防護鞋具，飲食注意補充蛋白質、維生素E及鋅元素促進甲板修復。真菌頑固感染者需在皮膚科醫師指導下規范用藥，定期復查肝功能。
