養血當歸糖漿與部分藥物存在配伍禁忌，主要需避免與抗凝藥、降壓藥及含金屬離子藥物同服。常見不宜聯用的藥物包括華法林、阿司匹林、硝苯地平等。
抗凝藥物如華法林與養血當歸糖漿同服可能增加出血風險。當歸中的香豆素類成分具有活血化瘀作用，與抗凝藥協同可能延長凝血酶原時間，導致皮下瘀斑、牙齦出血等不良反應。服藥期間需監測凝血功能，出現異常出血應立即就醫。
降壓藥如硝苯地平與本品聯用可能增強降壓效果。當歸提取物能擴張外周血管，與鈣通道阻滯劑合用可能引發低血壓，表現為頭暈、乏力等癥狀。建議間隔2小時以上服用，定期測量血壓變化。
含金屬離子的藥物如鋁碳酸鎂片、硫酸亞鐵片等可能影響藥效吸收。當歸中的有機酸成分易與鐵、鋁、鈣等金屬離子形成絡合物，降低雙方生物利用度。需錯開服藥時間至少1小時，必要時咨詢醫生調整劑量。
特殊情況下如需聯用上述藥物，建議在醫師指導下進行，并密切觀察是否出現心悸、皮疹等過敏反應。服藥期間避免食用辛辣刺激食物，糖尿病患者應注意本品含糖量。儲存時需密封避光，開封后超過一個月不宜繼續服用。
