多維元素片復合維生素礦物質補充劑通常適用于營養缺乏人群，但在以下情況不建議使用：
妊娠期女性需謹慎選擇配方。多維元素片中維生素A含量超過5000IU可能增加胎兒畸形風險，建議選擇專為孕婦設計的配方。部分產品含碘元素，甲狀腺疾病患者應在醫生指導下選用。
慢性腎病患者需避免高劑量礦物質。腎功能不全時難以代謝過量的磷、鉀、鎂等元素，可能引發電解質紊亂。維生素D過量補充可能加重血管鈣化，這類人群建議監測血鈣水平后再決定補充方案。
正在服用抗凝藥物者需注意維生素K干擾。華法林等藥物的療效會受維生素K影響，含維生素K的多維元素片可能降低抗凝效果。使用抗癲癇藥如苯妥英鈉時，大劑量葉酸可能降低藥物濃度。
已確診維生素蓄積性疾病者禁用。血色素沉著癥患者補充鐵劑會加重鐵沉積，威爾遜氏病患者需避免銅元素補充。長期大劑量維生素B6可能引發周圍神經病變，每日補充量不宜超過100mg。
某些特殊配方可能引發過敏反應。含酵母提取物的產品對真菌過敏者存在風險，海洋生物提取成分可能誘發海鮮過敏。選擇時應仔細查看輔料成分表，過敏體質者建議優先選擇單一營養素補充。
出現營養缺乏癥狀時，建議先進行血清微量元素檢測再針對性補充。盲目使用多維元素片可能掩蓋潛在疾病，如維生素B12缺乏可能提示萎縮性胃炎或惡性貧血。
