男性避孕藥通常不會對身體造成嚴重危險，但可能存在輕微副作用。男性避孕藥的作用機制主要有抑制精子生成、干擾精子成熟、阻斷精子輸送等途徑，目前臨床研究較多的包括睪酮衍生物、孕激素復合制劑、非激素類靶向藥物等類型。
激素類男性避孕藥常見副作用包括痤瘡、情緒波動、體重增加等，這些反應通常與體內激素水平暫時性調整有關，多數在停藥后可自行恢復。部分使用者可能出現性欲減退或精子數量恢復延遲現象，但現有臨床試驗數據顯示這些變化具有可逆性。藥物對肝功能、血脂代謝的影響通常處于可控范圍內，定期監測即可防范風險。
極少數情況下可能出現藥物過敏反應或心血管系統異常，這與個體對激素成分的敏感性差異有關。有血栓病史、嚴重肝腎功能不全者應避免使用。目前尚缺乏關于長期用藥安全性的權威數據，這與男性避孕藥研發歷史較短、上市品種有限有關。現有藥物在嚴格遵循醫囑使用的前提下，整體安全性評估結果較為樂觀。
使用男性避孕藥期間建議定期進行精液分析和激素水平檢測，出現持續頭痛、胸痛、皮膚黃染等癥狀應及時就醫。保持規律作息和均衡飲食有助于減輕藥物代謝負擔，避免同時使用其他激素類藥物。目前男性避孕藥仍處于不斷完善階段，用藥前應充分了解藥物特點并與醫生詳細溝通個人健康狀況。
